對於企業來說，人力資源管理系統是非常重要的，如今無論是大企業還是小企業都會使用到，只是大家所需要的功能模塊不一樣而已。通常大型的跨國公司需要的功能更多，例如公司內部會定期舉行培訓，所以就需要培訓功能方面的模塊。而薪酬管理系統則是已經包含在其中，幾乎所有的公司都需要。
人力資源管理系統能夠進行個性化的定制是有好處的，因為系統並不是免費提供給企業，需要成本支出購買，需要的功能越多，價格就會更貴。對於大企業預算比價充足，通常都不會考慮太多，而處於創業階段的小團隊，則會盡量精簡功能模塊，實現低成本支出。
其實企業也無須擔心功能多少的問題，因為人力資源管理系統是允許用戶自行添加新的功能模塊，也就是說當企業發展到一定規模的時候，考慮到需要添加更多的功能都可以，不會受到局限性，這一點是做得比較人性化的。
所以，早期使用人力資源管理系統並不需要太多的功能，特別是僱員不算很多的情況下，盡可能精簡一下即可。採用這套系統除了可以自由添加功能模塊，它也可以提高企業的行政效率，等於有機會為企業帶來更好的效益。
